常用的高温高压食品杀菌锅（杀菌斧）有立式和卧式两种。卧式杀菌锅使用更加方便，容量更大，是现在的主流。按照功能和结构的不同，可分成这样几个大类：高温和低温，蒸汽杀菌和过热水杀菌，单锅和双锅，水浴式和喷淋式，静止和回转杀菌，等。
选择杀菌锅时一般考虑以下因素：
1：根据产品的特点，选择杀菌温度。低温杀菌，还是高温杀菌，杀菌锅也可用于低温巴氏杀菌，但更多用于高温食品杀菌，大多杀菌温度选择108℃,118℃,121℃等。
例如：水果罐头属于酸性食品，其PH值一般在4.5以下，故多采用沸水或沸点以下的温度杀菌，可选用连续杀菌机或水浴式杀菌锅常压杀菌。而肉类食品除低温储藏食品外，大多选用121℃高温高压杀菌。
2：根据包装的不同选择不同的杀菌方式，高温蒸汽杀菌，还是高温高压水浴杀菌，或者喷淋调理杀菌。玻璃瓶装罐头和罐装罐头，可选用饱和蒸汽杀菌，或过热水杀菌。复合袋包装食品，塑料瓶装饮料，肠衣包装的高温食品，以过热水杀菌为宜。
3：根据产品品种的多少和产量大小，选择容量，单锅，上下罐双锅，以及多台并联运行。
小型企业可选用单台蒸汽杀菌锅，或上下罐全自动淋水式杀菌锅。
大型企业则以多台单锅并联运行更为经济合理。
4：对于像八宝粥，玉米羹或类似产品，为避免沉淀，改善热传导，还需考虑旋转式杀菌。
5：根据企业经济能力，选择普通碳钢杀菌锅，还是全不锈钢制杀菌锅，以及手动，半自动，和全自动杀菌锅。食品企业在合理选择杀菌锅时，要根据实际情况，除以上几点外，还要考虑杀菌温度的精度要求，是否需要保存历史记录，以及本公司的能源，供水供气和蒸汽的实际状况，综合考虑。或者按实际要求设计配管，更能做到经济实用，安全可靠。
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