近年来，淮阴区农业开发局围绕富民强区的目标，把扶持农业龙头企业和农民专业合作社作为推进农业产业化经营、带动农民增收的重要手段来抓，该区农业龙头企业和农民专业合作组织不断得到培育与壮大。至目前，共发展规模以上农业龙头企业72家，农民专业合作社总数已经达到1350多个，已经成为淮阴区推进农业增效、促进农民增收的重要推手。
自2009年以来，该局通过财政补助、贷款贴息等方式，累计投入资金2834.06万元（其中财政资金1577万元），先后扶持了江苏同玉禽业有限公司、江苏民康油脂有限公司、淮阴区惠民奶牛专业合作社等10家单位，为其注入新的生机和活力，壮大自身实力，增强带动了服务能力，有效地促进了生产、加工、销售和服务之间的紧密结合，提升了一体化经营水平。
在立项扶持时，该局围绕蔬菜、生猪、家禽等农业主导产业发展优势，优先扶持基础设施全和竞争力强的优势产品和产区，着眼于提高产业的竞争力，打造名牌产品，突出产业特色，提高产业的整体素质和经济效益。同时，坚持扶优扶大扶强的原则，重点支持带动力强、科技含量高的农产品精深加工项目和外向型龙头企业。加快产业基地建设，继续推行公司+基地+农户和合作社+基地+农户的运行机制，让农民在扶龙头、建基地中得到更多的实惠。在现有支持农业龙头企业和合作组织的财政补助和贷款贴息模式基础上，积极探索以投资参股的方式扶持农产品加工以及流通企业，多渠道、多形式地扶持龙头企业和农民合作组织。
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