去除杂质玉米收获时往往含有较多的末熟粒、破碎粒、糠屑及穗轴碎块等杂质，吸湿性强、呼吸量大、带菌量多、孔隙变小，容易积聚湿热导致发热生霉和虫害，所以玉米收获后必须过筛除去杂质再入库贮藏，以确保安全贮藏粮食。
干燥降温安全贮藏玉米必须控制好水分和温度条件，根据实践，玉米含水12.5%，温度35℃左右，一般能安全贮藏。
玉米收获后应充分暴晒或烘干处理，使其达到安全水分标准。贮藏中应注意通风散湿，新收获的玉米更应保持干燥和低湿条、件，才能确保安全。采用“双低”贮藏，低湿密闭投入、低剂量磷化铝片与自然降氧贮藏效果良好。
防治病虫用塑料薄膜压蒸或密封降氧贮藏不仅可防虫，同时防湿防毒效果亦好。对已经生虫的玉米可用过筛或药物熏蒸法防治。玉米颗粒大，一般害虫躯体小，采用6孔/寸筛除虫效果可达80%以上。用磷化氢药剂熏蒸费用低，杀虫也比较彻底。北方地区多利用冬季寒冷低温处理，将粮温降到0℃以下，趁冷密封，对防治甲虫和蛾类幼虫效果良好。
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