1、香菜的冻藏
东北各地多采用地沟冻藏，地沟分活沟和死沟两种。一般在风障、温室或立壕北侧的遮阳处挖一个宽、深各30厘米或宽70-100厘米，深30-70厘米的活沟。在活沟底顺沟长方向挖1-3条宽深各20-25厘米的通风道，通风道峡谷侧穿过窖沟的两端到地面上，通风道上面可稀蔬横放些单层秫秸，把香菜放在上面贮藏。
供冬藏的香菜，播种期应比直接上市采用松扎袋口的办法。扎袋时用2厘米粗的木棒插入袋口，扎紧后再抽出木棒，将口边卷起。贮藏期间不用开袋放风，的晚几天，收获期也应晚些，一般在早晚地面结冻，中午融冻时收获为宜。采收的香菜去掉泥土，摘去黄叶，1-1.5公斤捆成把或撒放在沟内，根身内，叶面撒一层沙土或沟面上盖一层秫秸，以后随气温下降，分2-3次加覆盖物，覆土总厚度为20-25厘米。严寒的季节可再在上面加盖草苫，沟内温度维持在-5-4℃，使香菜叶片冻结，根部不冻为宜，此法可贮到翌年2月底。香菜了出窖后要缓慢解冻，不能急躁。
2、香菜的窖藏
有堆藏和隙藏两种方式。窖内大量贮藏一般采用堆藏；少量贮藏香菜时一般采用隙藏。
堆藏是将香菜在窖内堆放，堆放的高度一般为25-30厘米。入窖初期，可把香菜堆放在菜窖两道大门之间的过道里或离窖门、气窗较近的地方。这里温度低，便于通风。待气温明显下降以后要移到菜窖内部贮藏。
隙藏就是在窖内白菜缝隙间贮藏香菜。白菜窖内的温度在0℃左右，而且白菜植株体内含水量较大，这正适合香菜低温高湿的贮藏条件。这种贮藏方法，在贮藏期间，要控制好窖内温度，使温度不能超过5℃，否则香菜叶子容易变黄腐烂。
3、香菜的气调冷藏
供贮藏的香菜应选棵大、株壮、颜色鲜绿、无病虫危害的植株。收获时留根1.5-2厘米长，收获后勿受热，及时加工处理，剔除病、伤等黄叶，捆成0.5公斤左右的小捆，上架预冷，在库温0℃条件下预冷12-24小时，当香菜体温达0℃时即可装袋冷藏，其袋是用聚乙烯薄膜制成，袋长1米，宽0.85米，厚0.08毫米，每袋可装8公斤香菜。这了方便调节袋内气体成分，可袋内二氧化碳平均值为7.8左右，氧气为10.3%左右，商品率和保鲜指数均达90%以上，损耗在7%-8%.松扎袋口贮藏香菜的库温，最好恒定在-1.5-1℃，不能过低。这种气调冷藏，可贮到翌年5月，效果很好。