功能饮料作为饮料界的新宠，新品种类和数量层出不穷，植物提取物作为主要功能配料，被广泛应用于功能饮料中，但在产品开发和生产过程中也会存在着一些问题，总结如下：
原料来源明确
植物提取物作为食品原料使用，必须有明确的来源，国际范围内，植物提取物作为功能饮料的原料已经被广泛使用，在国内，由于政策和法规的限制，提取物作为普通食品原料，能够使用的种类不多，《GB 2760-2014 食品安全标准 食品添加剂使用标准》中提及的提取物包括迷迭香提取物、瓜拉纳提取物、丁香花蕾酊（提取物）、核桃壳提取物、可乐果提取物、生姜提取物、角豆提取物等。在保健食品中，作为固体冲剂和口服液剂型，能够应用的提取物范围则比较宽泛，其中大部分果蔬及药食同源植物的提取物都能够应用。
产品安全有效
植物提取物作为功能饮料的成分，安全是前提，在美国，植物提取物类的产品如果应用在功能饮料中，必须要经过GRAS的认证，如果符合GRAS的要求，可以向FDA提出备案，备案通过即可作为合法原料进行使用。在国内，提取物作为普通食品原料使用，则需要进行新食品原料或者食品添加剂的认证，通过以后即可视为安全的原料应用到普通食品中。关于提取物类产品的有效性，国内外一些大的提取物公司都在开展相关方面的研究工作，都有相当完整的研究成果和研究报告。
功能成分明确
植物提取物本身成分比较复杂，同一种植物提取物有不同的成分，甚至同一种成分由于含量高低的不同也分为不同的规格，以茶提取物为例，提取物的有效成分包括茶多酚、茶黄素、茶氨酸等，如果要开发抗氧化类型的功能饮料，需要选取茶多酚含量适宜的绿茶提取物，如果要开发抗癌类的功能饮料，则需要选取茶黄素含量适宜的绿茶提取物，如果要开发缓解神经疲劳的产品，则需要选取茶氨酸含量适宜的绿茶提取物。葡萄提取物也有不同的规格，有效成分包括原花青素和白藜芦醇，对于开发不同功能的饮料，则需要选取合适规格的提取物。
生产规范稳定
在国内，功能性饮料包括保健食品和普通食品，目前统一由食品药品监督管理局管理，厂家达到生产要求，颁发生产许可证（SC证），生产厂家生产的产品必须符合相关的法律法规，配方的合规性，生产的稳定性都有严格的要求，按要求添加的提取物也必须符合相关的规定。
良好的外观和口感
在颜色方面，如花色素类的提取物都有着鲜艳的色彩，并且根据PH值的不同，在产品体系中可以呈现不同的颜色，既能提升产品的功效，又可以调整产品的颜色；在口味方面，由于提取物本身的特性，其口感比常规的食品原料要差，大多数提取物都有苦涩感和其他不良风味，把提取物作为原料加入功能饮料中既要发挥提取物的功效，又要把其不良的风味进行掩盖，让产品的口感能够被广大消费者接受，并且又自身的特点。
完善的学术和售后支持
以植物提取物作为原料的功能饮料，定位和以往的快消品饮料不同，在市场和推广方式上也有很大的区别，除去必要的广告宣传外，产品人对产品甚至原料的理解要更加深入，除了具备食品的专业知识，对植化甚至药化也要有一定程度的了解，产品研发人员更是要具备极高的专业知识，这样才能对产品有着更好的学术和售后支持。
稳定可靠的供应链体系
以提取物为原料的功能饮料，当产品当量能达到一定数量级后，提取物原料的供应能力，厂商的生产能力，配套包装的供货能力及物流能力都要满足要求，并且有持续性，只有能达到这个要求，产品才会有可靠的供应保障，当市场不断扩大，产品的供应能力依然能够满足。
基于功能饮料市场的井喷式增长，并且伴随着这些问题，行业内部的CRO公司应运而生，本年度营养配料大奖（Nutralngredients Awards）评选出的年度服务商（Service Provider of the Year）:Anlyze & Realize即是一家做CRO的德国公司。在国内，益倍生物作为国内大健康CRO的领先企业，其主要业务为从事配料和产品的研究、新型食品开发项目、健康声称开发、市场趋势分析、为客户确定创新策略等，益倍生物致力于服务于国内的大健康企业，将植物功能产品细分市场做精做强。