我国正处在社会经济转型时期，奶业发展亦刚好进入到从传统奶业转向现代奶业这一转变过程，由于新旧观念的冲突和各方利益的抟弈，在发展前行中必然会发生或存在这样或那样的障碍或阻力、困难或问题。目前而言，在我国奶业发展中所存在的问题，归纳起来主要包括有如下一些：
一、信任问题
三聚氰胺事件负面影响挥之不弃，消费者对国产奶信心不振，行业信任危机依然存在。这一问题，已经被列为整个奶行业的最为重要的、同时又是亟需解决而又最难解决的一道难题。
桓天然前任首席执行官（CEO）西奥。史毕根斯，不久前在接受中国媒体时说过这样的一句话："牛奶价格并不是我担心的问题，我担心的是消费者的信心，我们都知道，牛奶价格是由供需关系决定的"。西奥换句话说，消费者的信心是不由我们生产企业来决定的。西奥也是在告诉大家，失去了人心也意味着没有未来的市场。
二、奶源问题
奶业资源分布不合理，产奶区高度集中在黑龙江、内蒙古等北方八省区。这不合理的产业布局，是在人为地造成了北奶南调而增高了奶产品的运输成本；此外，还使得奶业欠发达地区大量的可利用的牧草、饲料白白地被浪费掉，而无法将其转化为蛋白质。
过于套用工业发展"做大做强"的理念来发展奶业，违背了农牧业及乳品生产的地资源地利用、地养殖地加工、地消费和适宜适度发展的这一发展规律。中国奶业资源较为分散，高度集中使用成本重，即使企业做大了也很难做强。而全球这一行业的做法或规律是："适度规模做强做精做好"。
消费者对国产奶不放心，国内企业对国产奶源质量也不放心。广东的乳企，这几年90%以上的都在使用进口奶粉，完全使用本土奶源的只有一、二家;最近一、二年来，一些大型企业纷纷跑到国外寻找奶源，今年对外投资总签单多达近70亿元人民帀。这些行业状况，实际上是反映出了国内乳企对国严奶源不太放心。
三、发展问题
企业急功近利，产品假借高端之名价位不断虚高。有些企业的高端单一产品年销售高达75亿元之多，而成本连一半都不到，这是一个暴利产品，这种暴利是建立在对消费者欺骗的基础上的。奶行业产业链利益分配严重失衡，利润分配不合理。上游养殖业的利润占10%还不到，奶农完全没有议价权，奶价议价权全掌控在乳品企业手中，奶农的利益得不到保障，亏本养不下去时只好卖牛杀牛甚至是弃养。企业经营实力欠缺，抗市场风险能力差。一遇外资迫近和洋牛奶、洋奶粉的入市冲击朿手无策，甚至是市场失守。
盲目扩张，加工产能严重过剩，过剩达50%以上。在此背景下，伊利今年还分别3月在山东投4.9亿元、6月在宁夏投4.49亿元、12月在四川投4.04亿元扩建3家UHT奶加工厂。一边要中小企业离场，一边是大企业无限量在扩建。
产业发展模式、经营模式形无定式。从过去的每家每户3~5头散养，到公司十农户，到奶农社，到养殖社区，到万头牧场，从一个极端走向另一个极端。而南方的家庭规模牧场模式，则得不到推广。
企业浮躁，乱定价、乱宣传、乱标识，虚假广告满天飞。明明是乳饮料，却标榜牛奶销售。生态循环经济、低碳环保经济意识差，牧场设计、牧场经营、乳品产品选定及加工工艺等都未能达到环保生态的要求。
所谓的资本运作型企业及经营手法，受到吹捧和鼓励。而这些企业基本上是靠卖股份、股票在套钱。这类企业对整个奶行业而言，实质上是一个搅局者，原来的平静、原来的平衡、原来的秩序、原来的行业规则，都让他们搅乱了。
四、标准问题
标准粗糙，生奶国标落后。没有高标准，难有好奶源，没有好奶源，何来做出好产品？标准低也是影响消费者对国产奶不放心的原因之一，国标不复高，消费者的信心也不会回来。从业者社会责任、道德、行为准则不到位，企业欠诚信，行业自律差。生奶加入杀菌剂保鲜，该杀的病牛而不杀而转卖他人宰上市，乳品加入防腐剂等。
五、奶农问题
牛、草未能同步平衡发展。其中苜蓿草的缺口还差一半，需靠进口弥补解决，2012年的进口量44.22万吨，2013年是74.77万吨，2014年预计达110万吨。
疾病、疫情防控不力。几乎每隔二、三年有病疫情发生或流行，对奶牛"两病"的净化工作抓得不够落实，病牛商品化流通时有发生。广东今年有2个牧场从北方买了2批奶牛群数百头，有当地的检疫证明，买回后不到二、三月牛病死了百多头，损失惨重。
散户奶农退出过早过快过多，乳企自办奶源过小过慢，跟不上。企业重加工，轻养殖，自办奶源积极性不高，且缺乏一个量化指标。山东泰山区省庄镇东孙村，原几乎家家在养奶牛，每天可产出10吨的牛奶。这一次因受奶荒掉价影响，现在已经有90%的奶农弃养。
六、政策问题
政策导向存在着偏差。提倡资源高度流转集中，抓大压小;打造婴儿奶粉队，连外企都进入名榜;兼并重组对外资不设防;重新认证证假洋鬼子奶粉变身真洋鬼子洋奶粉继续留在中国市场争分份额等。资质审核重新认证，未能有效拦截样奶粉的大举涌入。
七、产销问题
生鲜奶源、乳品的食品质量安全信息不透朋、不对称。养殖与加工脱节、分离，独行运作，缺乏互相通气和利益协调。产品结构不理性不合理，乳企重常温奶轻巴氏鲜奶。过多过量使用还原奶，无法拉动生鲜奶源和养殖业的扩大发展。产品销售环节繁多，管道成本重，厂家直对商家的传统简洁的商贸形式被抛弃，大众平民产品被卖出贵族价，使消费者无奈增加了消费成本。
对以上所列的我国奶业发展中所存在的这些问题，首先，我们应该勇敢地面对它、正视它，不要被这些问题和困难所吓倒和失去信心;其次，是要以积极的态度去想办法，去将这些问题一个个地克服和解决。